2006年1月，外经贸专用网主中心落成典礼隆重举行，薄熙来部长及商务部党组成员为专用网主中心剪彩，外经贸专用网主中心正式启用。

　　 2006年1月，全国代表处工作会议在广东珠海召开，此次会议正式出台新的营销管理模式，在销售管理体制上实行区域化管理，充分发挥代表处作为营销渠道主力军的作用，中心的销售渠道改革进一步推向深入。

　　 2006年1月，中心2005年度技术职称评审工作圆满结束，易宇荤等15人获得高级工程师资格，张建军等32人获得工程师资格。

　　 2006年2月，国富安公司数字证书认证系统及密钥管理系统等两个系统顺利通过国家密码管理局组织的安全性审查。

　　 2006年2月，联合国电子化标准组织主题会议在马来西亚吉隆坡隆重召开，丁强总经理以泛亚联盟督导委员会主席的身份应邀出席会议并代表泛亚联盟做主题演讲。

　　 2006年3月，在商务部首次“商务部表彰大会”上，中心国富通公司因在商务部政府网站建设和政务信息工作中的杰出成就，获商务部集体嘉奖；王志平书记因在商务部办公楼维修改造工程中有突出贡献，获个人三等功；政府业务部戚伟因在为商务部各司局提供技术服务工作中表现突出，获个人嘉奖。

　　 2006年3月，在中央电视台3.15晚会上，姜增伟副部长代表商务部、全国整规办宣布中心承办的“中国反商业欺诈网”正式开通并致辞，中心刘俊生主任陪同姜增伟副部长出席了开通仪式。

　　 2006年3月，中心刘俊生主任亲自为获商务部集体嘉奖的国富通公司以及获商务部个人嘉奖的政府业务部戚伟颁奖，以资鼓励。

　　 2006年4月，中心获得中央国家机关2005年度文明单位、中央国家机关2005年度平安建设优秀单位称号、商务部2005年度计划生育、绿化、爱国卫生先进单位称号。

　　 2006年4月，“中国国际贸易企业应用电子商务平台”在第99届广交会上正式启动。

　　 2006年4月，在人民大会堂举行的中国保护知识产权企业高层论坛上，国家保护知识产权工作组办公室主任、商务部副部长姜增伟宣布中心承办的中国保护知识产权网正式开通。

　　 2006年5月，由亚太经合组织（APEC）和商务部主办，APEC电子商务工商联盟、中国国际电子商务中心、青岛市人民政府承办的“第二届APEC电子商务工商联盟论坛”在青岛成功召开。会后APEC秘书处给APEC电子商务工商联盟秘书处发来感谢信，对APEC电子商务工商联盟秘书处在所作出的杰出工作表示感谢。

　　 2006年5月，国富安公司取得了中华人民共和国信息产业部颁发的“电子认证服务许可证”，成为国家部委中唯一取得该资质的机构。

　　 2006年6月，由中心开发建设的商务部纺织品临时出口许可数量转受让平台正式运行，该平台的开通解决了困扰纺织品进出口企业许久的中美纺织品协议执行率过低的问题，成为中国纺织品临时出口许可管理的交易中心。

　　 2006年6月，中心与对外经济贸易大学合作建设学生实习基地协议签字及揭牌仪式举行，对外经贸大学副校长刘亚、中心常务副主任王建国、张念录副总裁等领导出席仪式。该实习基地的建立将充分发挥中心优势，在为大学生提供社会实践机会的同时丰富中心的人力资源储备。

　　 2006年6月，中心举行国富安CA第100家业务技术支持服务机构授牌仪式，这标志着商务部CA技术服务机构已经覆盖全国。

　　 2006年7月，中国国际电子商务中心“商用密码生产定点单位”资质获得了国家密码管理局的批准，中国国际电子商务有限公司被指定为“商用密码产品生产定点单位”。

　　 2006年8月，全国“诚信兴商宣传月”活动新闻发布会在京召开，宣传月期间，将由中心承办两场“诚信兴商”网上论坛，论坛由“中国反商业欺诈网”、人民网、中国网、中青网、央视国际、新浪网进行同步预告、同步播报。

　　 2006年8月，中国国际电子商务安全签章平台开始试运行。该平台以《电子签名法》为法律依据，主要解决电子政务和电子商务等领域中网络身份认证、电子合同、电子票据以及网上签约的合法性问题，为企事业单位、政府机关、商务活动提供有效支持。

　　 2006年9月，中心与中国华联集团举办签约仪式暨新闻发布会，联合打造面向海内外供应商的超级B2B网上交易平台――中国华联全球采购电子商务平台。

　　 2006年10月，由亚太经合组织(APEC)和中华人民共和国商务部共同主办，APEC电子商务工商联盟、中国国际电子商务中心承办的“APEC电子贸易与供应链管理培训班”成功举办，来自经合组织（OECD）、泛亚电子商务联盟（PAA），美国、韩国、俄罗斯、墨西哥、秘鲁、中国以及中国香港等APEC经济体的政府官员、企业主管共70余位代表参加了培训。

　　 2006年10月，广州备份中心工程竣工。刘俊生主任视察了外经贸专用网广州分中心的建设情况，对建设工程给予了充分肯定，并主持召开了广州分中心成立暨第一次办公会议，宣布广州分中心正式成立。

　　 2006年10月，由中心主办、国富安公司承办的国家部委信息化高层峰会在京举行。会上，中心在国家部委中率先提出了“共建公众服务电子认证体系”的倡议，并得到了与会领导的认同。

　　 2006年10月，在第十三届中国广告节“诚信广告中国行”活动中，中心荣获“媒体组织奖”。

　　 2006年11月，中国国际电子商务有限公司与美国TradeBeam公司签署战略合作协议，通过签署该战略合作协议，双方公司将在平等协商、互惠互利、共同发展的基础上，通过优势互补，共同打造CIECC“企业端应用管理系统”。

　　 2006年11月，国富安公司成为北京经济技术开发区园区中唯一一家“专利引擎”试点企业。此项资格的取得将使国富安公司享受实际支付的国内外专利申请费、发明专利实审费的全额资助和专利知识培训等待遇。

　　 2006年12月，在人民大会堂举办的中国对外贸易年会暨“中国对外贸易最具影响力企业推介”活动中，中心被授予“中国对外贸易最具影响力企业”。

　　 2006年12月，鉴于中心在我国电子商务发展中的重要作用，国家标准化委员会正式批准中心作为“国家电子商务标准化总体组”成员单位。